<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE article PUBLIC "-//NLM//DTD JATS (Z39.96) Journal Publishing DTD v1.3 20210610//EN" "JATS-journalpublishing1-3.dtd">
<article article-type="conference-paper" dtd-version="1.3" xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xml:lang="ru"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">endoserg</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="ru">Эндокринная хирургия</journal-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Endocrine Surgery</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn pub-type="ppub">2306-3513</issn><issn pub-type="epub">2310-3965</issn><publisher><publisher-name>Типография «Печатных дел Мастер»</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="doi">10.14341/serg12864</article-id><article-id custom-type="elpub" pub-id-type="custom">endoserg-12864</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="heading"><subject>Research Article</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="ru"><subject>Эндокринная онкология</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="section-heading" xml:lang="en"><subject>Endocrine oncology</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title>Спектр генетических мутаций, выявляемых у пациентов при секвенировании таргетной панели «Аденомы гипофиза»</article-title><trans-title-group xml:lang="en"><trans-title>Spectrum of genetic mutations detected in patients during sequencing of the target panel «Pituitary adenomas»</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Захарова</surname><given-names>В. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Zakharova</surname><given-names>V. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Москва</p></bio><email xlink:type="simple">endocrinesurgery@endocrincentr.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Солодовникова</surname><given-names>Е. Н.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Solodovnikova</surname><given-names>E. N.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Москва</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Забудская</surname><given-names>К. Г.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Zabudskaya</surname><given-names>K. G.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Москва</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib><contrib contrib-type="author" corresp="yes"><name-alternatives><name name-style="eastern" xml:lang="ru"><surname>Попов</surname><given-names>С. В.</given-names></name><name name-style="western" xml:lang="en"><surname>Popov</surname><given-names>S. V.</given-names></name></name-alternatives><bio xml:lang="ru"><p>Москва</p></bio><xref ref-type="aff" rid="aff-1"/></contrib></contrib-group><aff xml:lang="ru" id="aff-1"><institution>ФГБУ «НМИЦ эндокринологии» Минздрава России</institution><country>Russian Federation</country></aff><pub-date pub-type="collection"><year>2023</year></pub-date><pub-date pub-type="epub"><day>21</day><month>12</month><year>2023</year></pub-date><volume>17</volume><issue>4</issue><fpage>41</fpage><lpage>41</lpage><permissions><copyright-statement>Copyright &amp;#x00A9; Захарова В.В., Солодовникова Е.Н., Забудская К.Г., Попов С.В., 2024</copyright-statement><copyright-year>2024</copyright-year><copyright-holder xml:lang="ru">Захарова В.В., Солодовникова Е.Н., Забудская К.Г., Попов С.В.</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="en">Zakharova V.V., Solodovnikova E.N., Zabudskaya K.G., Popov S.V.</copyright-holder><license xml:lang="ru" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>Данная работа распространяется под лицензией Creative Commons Attribution 4.0.</license-p></license><license xml:lang="en" license-type="creative-commons-attribution" xlink:href="https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/" xlink:type="simple"><license-p>This work is licensed under a Creative Commons Attribution 4.0 License.</license-p></license></permissions><self-uri xlink:href="https://www.surg-endojournals.ru/jour/article/view/12864">https://www.surg-endojournals.ru/jour/article/view/12864</self-uri><abstract><sec><title>Актуальность</title><p>Актуальность. Таргетные генетические панели — основной инструмент диагностики врожденных патологий в практике врача эндокринолога. Целью их выполнения является установление диагноза и определения оптимальной для конкретного пациента тактики лечения. Секвенирование следующего поколения таргетной генетической панели известных генов, мутации в которых ассоциированны с аденомами гипофиза, акрогигантизмом, многоузловым зобом и другими эндокринными неоплазиями, является инструментом первой линии генетической диагностики, что крайне необходимо для понимания патогенеза, улучшения прогноза и лечения таких пациентов.</p></sec><sec><title>Методы</title><p>Методы. В исследование были включены 77 пациентов в возрасте от 5 до 40 лет. Для пробоподготовки использовалась прошедшая контроль качества геномная ДНК, полученная из образцов периферической крови. Подготовка геномных библиотек производилась согласно протоколу производителя c использованием авторской таргетной панели зондов. Секвенирование готовых библиотек осуществлялось методом массового параллельного секвенирования (next-generation sequencing, NGS) в режиме парно-концевого чтения (2x150п.о.) на платформе Illumina Nextseq 550. Обработка данных секвенирования проведена с использованием автоматизированного алгоритма, включающего выравнивание прочтений на референсную последовательность генома человека (hg38), постобработку выравнивания, идентификацию и фильтрацию вариантов по качеству, а также аннотацию идентифицированных вариантов для всех известных транскриптов каждого гена из базы данных RefSeq.</p></sec><sec><title>Результаты</title><p>Результаты. По результатам молекулярно-генетического метода исследования удалось подтвердить диагноз у 32% пациентов (n=25). У 52 пациентов генетическая причина не была выявлена, что в целом согласуется со средней выявляемостью для методик NGS. Патогенные и вероятно патогенные варианты были выявлены в генах DICER1, PTEN, AIP, CHEK2, SDHA и MEN1. Наиболее часто у исследуемой группы пациентов были обнаружены патогенные и вероятно патогенные варианты в гене DICER1 (в том числе одна протяженная делеция), варианты с неопределенной клинической значимостью были выявлены в генах PRKAR1A, APC, CDKN1B. Среди выявленных генетических вариантов 12 были ранее описаны в литературе, а 13 выявлены впервые.</p></sec><sec><title>Заключение</title><p>Заключение. Проведение полноэкзомного и полногеномного секвенирования у пациентов без генетических находок по панельному секвенированию с целью поиска мутаций в известных генах и поиск новых генов-кандидатов, варианты в которых могут быть ассоциированны с развитием различных эндокринных новообразований, представляет собой перспективное направление генетических исследований.</p></sec></abstract><trans-abstract xml:lang="en"><p>.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>таргетные панели</kwd><kwd>секвенирование следующего поколения</kwd><kwd>NGS</kwd><kwd>аденомы гипофиза</kwd><kwd>многоузловой зоб</kwd></kwd-group></article-meta></front><back><ref-list><title>References</title></ref-list><fn-group><fn fn-type="conflict"><p>The authors declare that there are no conflicts of interest present.</p></fn></fn-group></back></article>
